运输署表示,港珠澳大桥启用初期,屯门至赤鱲角南面连接路尚未启用,来往香港口岸及市区的跨境及本地交通,必须取道机场岛上的道路,将在大桥启用初期采取临时特别交通安排。包括分阶段向持有使用大桥的粤港两地牌跨境私家车配额申请人,发出“封闭道路通行许可证”,在大桥启用前发出最多5000张许可证,启用三个月后额外发出最多3000张许可证,当屯门至赤鱲角南面连接路主线启用后,陆续发出其余许可证,并容许现在持有配额使用其他口岸的两地牌跨境私家车,免手续试用大桥。
署方又会限制,前往香港口岸及机场的部分本地工程车,在非繁忙时间使用机场及大屿山附近的连接道路;有需要时安排部分来往香港口岸的专营巴士,改行车流量较低的连接道路。运输署表示,当屯门至赤鱲角南面连接路主线启用,会视乎实际的交通情况,调整特别交通安排。